Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lin28bQ45KJ6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lin28bQ45KJ6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lin28bQ45KJ6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lin28bQ45KJ6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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