Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Carmil2Q3V3V9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.9 ms