Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pydc3Q3V3Q4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms