Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms