Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms