Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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