Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Obox3Q3UT54 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms