Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms