Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms