Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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