Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Usp19Q3UJD6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Usp19Q3UJD6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Usp19Q3UJD6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Usp19Q3UJD6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Usp19Q3UJD6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Usp19Q3UJD6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
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