Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms