Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms