Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms