Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms