Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms