Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U595 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U595 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U595 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U595 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U595 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U595 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U595 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U595 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U595 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U595 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U595 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U595 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q3U595 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q3U595 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q3U595 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q3U595 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q3U595 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Q3U595 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q3U595 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q3U595 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U595 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Q3U595 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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