Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf40Q3U319 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf40Q3U319 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf40Q3U319 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf40Q3U319 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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