Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Otud5Q3U2S4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud5Q3U2S4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms