Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KhsrpQ3U0V1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms