Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms