Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88bQ3TYP4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms