Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccndbp1Q3TVC7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccndbp1Q3TVC7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccndbp1Q3TVC7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccndbp1Q3TVC7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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