Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms