Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms