Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpgp1Q3TLS3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpgp1Q3TLS3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpgp1Q3TLS3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms