Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc10Q3TLI0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms