Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trappc13Q3TIR1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trappc13Q3TIR1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trappc13Q3TIR1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trappc13Q3TIR1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trappc13Q3TIR1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc13Q3TIR1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc13Q3TIR1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc13Q3TIR1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc13Q3TIR1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc13Q3TIR1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc13Q3TIR1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc13Q3TIR1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Trappc13Q3TIR1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trappc13Q3TIR1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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