Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms