Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Samd11Q1RNF8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Samd11Q1RNF8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms