Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cpne9Q1RLL3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cpne9Q1RLL3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cpne9Q1RLL3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cpne9Q1RLL3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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