Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptcd3Q14C51 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ptcd3Q14C51 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ptcd3Q14C51 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ptcd3Q14C51 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ptcd3Q14C51 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptcd3Q14C51 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms