Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Perm1Q149B8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms