Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms