Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rab42Q0PD08 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms