Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Neurl1bQ0MW30 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms