Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms