Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms