Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp2Q08652 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms