Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
AmbpQ07456 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AmbpQ07456 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms