Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cntn3Q07409 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cntn3Q07409 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cntn3Q07409 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntn3Q07409 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntn3Q07409 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cntn3Q07409 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms