Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nfe2Q07279 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nfe2Q07279 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfe2Q07279 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfe2Q07279 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nfe2Q07279 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfe2Q07279 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfe2Q07279 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nfe2Q07279 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfe2Q07279 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nfe2Q07279 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nfe2Q07279 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfe2Q07279 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nfe2Q07279 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nfe2Q07279 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nfe2Q07279 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfe2Q07279 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nfe2Q07279 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nfe2Q07279 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfe2Q07279 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfe2Q07279 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfe2Q07279 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfe2Q07279 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfe2Q07279 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nfe2Q07279 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfe2Q07279 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfe2Q07279 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nfe2Q07279 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms