Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cab39Q06138 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms