Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms