Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms