Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb5Q02739 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms