Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdcd1Q02242 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms