Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ascl1Q02067 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ascl1Q02067 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ascl1Q02067 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ascl1Q02067 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ascl1Q02067 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ascl1Q02067 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ascl1Q02067 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ascl1Q02067 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms