Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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RykQ01887 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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RykQ01887 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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RykQ01887 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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RykQ01887 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RykQ01887 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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