Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Hoxd1Q01822 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Hoxd1Q01822 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Hoxd1Q01822 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms